故事讲述21世纪有两位天才女高中生，降临在这个靠打麻将实力来左右人生的时代。　　一位是每一次都能够以正负0分没输没赢的方式打完牌局的少女宫永咲。　　另一位是在全国中学生麻将大赛个人组中夺冠的少女，经验数据系选手原村和。　　因某次偶然的相会，和被咲不在乎输赢的打法所击败，对咲说出“你不喜欢麻将”这句话

岩仓玲音的同学四方田千砂自杀了。没有任何前兆的自杀事件让同学们不知所措，一周后，玲音收到了千砂的短信。明明已死的千砂居然以手机短信和玲音开始了交流。回到家，玲音用爸爸给她的电脑开始与千砂联系。当谈及为何自杀时，千砂回答说“因为我已经不需要身体了，没有身体，我可以在wired网络之间继续活着。”不解的

故事以一連串女高中生離奇死亡的事件開始，深陽學園2年C組的女學生宮下藤花原來隱藏著「Boogiepop Phantom」的第二重人格，行為奇異，究竟宮下是否這些死亡事件的主谋？　　「Boogiepop Phantom」到底是都市中傳說的死神，還是正義的使者？